شرح اصولالکافی؛ الوَجیزة فیالتوحید؛ مُنْتَخَبُ الْمِلل و النحل، گزیده اثر محمد بن عبدالکریم شهرستانی؛ حاشیه بر بخش الهیات شرح الاشارات و التنبیهات خواجه نصیرالدین طوسی؛ حاشیه بر شرح التذکرةالنصیریة عبدالعلی بیرجندی. شمسالدین محمد خفری و نیز جلالالدین محمد دوانی بر شرح جدید تجرید، اثر علی بن محمد قوشچی، حاشیه نوشته بودند و میرمحمدمعصوم بر حاشیه هر دو آنها حاشیه نوشته است.